Chablis’n alue on kalkkikivinen ylänkö, jonka halkovat laaksot. Premier Crus -viinien viinitarhat sijaitsevat kerrostumassa, joka on peräisin Kimmeridgian-kaudelta (noin 155 miljoonaa vuotta sitten), ja jossa vuorottelevat savi- ja kalkkikivikerrokset sekä pienet osterifossiilit kivessä. Nämä fossiilit ovat jäänteitä lämpimästä ja matalasta merestä, joka aikoinaan peitti Burgundyn alueen.

Tarhat sijaitsevat Pohjois-Burgundiassa lähellä Auxerrea, viinitarhat ovat pienen joen varressa, jonka nimi on Serein.